Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00607-205ENST00000445174 3690 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MPP2-202ENST00000377184 4206 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ARFGAP2-205ENST00000524782 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CTPS2-202ENST00000380241 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DENND5A-210ENST00000530044 4060 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CSF3R-205ENST00000373106 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CLPB-203ENST00000437826 3379 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PTK2B-205ENST00000420218 3941 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590132.1-201ENST00000639602 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 POP1-201ENST00000349693 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SALL1-202ENST00000440970 5253 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF9-233ENST00000637520 5682 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SELENOT-207ENST00000615547 3488 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC003958.2-202ENST00000432258 3890 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX2-201ENST00000258991 5232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIP12-203ENST00000389044 6405 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ILK-215ENST00000537806 1801 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RIN2-201ENST00000255006 4505 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ITIH3-201ENST00000416872 2220 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EFNA5-201ENST00000333274 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CIZ1-207ENST00000393608 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL27-201ENST00000259631 446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR55-202ENST00000392040 3828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SPACA3-203ENST00000394638 508 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 U3.34-201ENST00000408198 212 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL627082.1-201ENST00000443847 235 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TNNT3-210ENST00000446240 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138895.1-201ENST00000448674 173 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL100P-201ENST00000460565 293 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL586P-201ENST00000479137 296 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL141P-201ENST00000484215 266 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL285P-201ENST00000496478 264 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093162.2-201ENST00000501107 704 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010457.1-202ENST00000510137 337 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3945HG-201ENST00000510284 576 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL662844.2-201ENST00000538455 284 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BTNL2-205ENST00000544175 845 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC055716.1-201ENST00000550077 495 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3183-201ENST00000578566 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 C17orf62-220ENST00000580560 564 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC019322.3-201ENST00000616104 478 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 OGFOD1-207ENST00000566157 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GFM2-202ENST00000345239 2856 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PTCH1-206ENST00000421141 7659 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GCNT1-201ENST00000376730 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF304-202ENST00000391705 4313 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CIT-201ENST00000261833 8578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK5RAP1-210ENST00000473997 1930 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMC9-214ENST00000611582 5759 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LHX6-203ENST00000373755 3384 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SECISBP2L-209ENST00000559471 7176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HERC2P2-205ENST00000619021 5746 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms