Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TNP2Q05952 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms