Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AL109945.1-201ENST00000448134 687 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DCD-202ENST00000456047 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL400P-201ENST00000473634 296 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL364P-201ENST00000473668 272 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL584P-201ENST00000492309 297 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PART1-201ENST00000504876 5616 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TECRP1-201ENST00000513307 445 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC100810.2-201ENST00000517626 927 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003064.2-201ENST00000528983 510 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355076.3-201ENST00000555838 587 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPCP18-201ENST00000560619 439 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016168.2-202ENST00000564292 610 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL711P-201ENST00000579731 299 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR2467-201ENST00000584559 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355989.2-201ENST00000603304 512 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MECP2-212ENST00000611468 603 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00623-202ENST00000614062 830 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BX510359.6-201ENST00000615765 343 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244226.1-201ENST00000631943 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012507.4-201ENST00000637275 504 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHA5-206ENST00000622150 8421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NFASC-207ENST00000404907 5447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TTLL5-202ENST00000298832 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PTCH1-208ENST00000430669 8232 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HAP1-201ENST00000310778 4087 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GGA3-202ENST00000538886 3766 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGEE1-201ENST00000361470 3630 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MTR-205ENST00000535889 10405 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DENND2A-210ENST00000537639 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX13-210ENST00000618875 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB5B-210ENST00000553116 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PXYLP1-202ENST00000393010 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXL20-201ENST00000264658 10388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LONP2-203ENST00000535754 2580 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT80-201ENST00000313234 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAP2-201ENST00000344138 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PAXIP1-201ENST00000397192 3711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNB1-201ENST00000371741 11879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC132825.3-201ENST00000562182 4710 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0040-201ENST00000423313 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA8A-202ENST00000432566 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L13-215ENST00000611738 4817 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RPH3A-201ENST00000389385 4679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM22-205ENST00000398209 9144 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR91-202ENST00000423565 4500 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC16A14-201ENST00000295190 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SMC6-207ENST00000448223 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 STAG1-203ENST00000434713 5064 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PDXDC1-216ENST00000569715 3775 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF217-201ENST00000302342 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PMEL-206ENST00000548747 2757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KPNA3-201ENST00000261667 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ATMIN-206ENST00000566488 5343 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF343-208ENST00000617391 3300 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSBG1-214ENST00000560817 2462 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF19-201ENST00000376255 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMCX3-201ENST00000341189 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL6B-201ENST00000293805 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM184B-201ENST00000361684 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 XPO6-208ENST00000565698 4255 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RBBP6-201ENST00000319715 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS39-201ENST00000318006 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EDRF1-202ENST00000356792 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CALD1-202ENST00000361901 4114 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC23B-204ENST00000377475 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NOL4-201ENST00000261592 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR17-206ENST00000544369 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SZT2-209ENST00000562955 13968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms