Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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