Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL645949.1-201ENST00000510094 324 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGHVIII-51-1-201ENST00000519403 302 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP007216.1-201ENST00000563932 385 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02280-201ENST00000564585 3816 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL138P-201ENST00000577405 287 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR4440-201ENST00000583986 98 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013553.3-201ENST00000612943 615 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPV1-202ENST00000399756 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 DSG1-201ENST00000257192 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLRP1-203ENST00000345221 4656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC7A3-201ENST00000298085 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 KANSL3-206ENST00000431828 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNHG14-210ENST00000546682 8842 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZEB2-245ENST00000638087 9339 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 KANK1-210ENST00000619269 5688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 IQSEC2-201ENST00000375365 4004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCN5A-203ENST00000413689 8504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCC11-202ENST00000356608 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDH7-202ENST00000397968 12231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC24A1-203ENST00000399033 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 DISP1-201ENST00000284476 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FUT10-201ENST00000327671 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM172A-201ENST00000395965 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCEH1-205ENST00000538775 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAN2-203ENST00000440411 4576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYB5R4-202ENST00000369681 9252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCC11-201ENST00000353782 4463 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ICAM1-201ENST00000264832 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMOD3-201ENST00000308580 8255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP35-201ENST00000526425 3770 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC023824.7-201ENST00000623041 5731 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAST4-201ENST00000261569 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 BBS9-201ENST00000242067 4027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 LARS2-201ENST00000265537 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TACC2-210ENST00000369005 9673 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PKNOX1-203ENST00000432907 5180 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GDNF-AS1-205ENST00000637926 3819 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF304-202ENST00000391705 4313 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLN-201ENST00000380985 8661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 LAMA1-201ENST00000389658 9657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005077.4-201ENST00000421546 3495 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 BACH2-202ENST00000343122 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPS33-201ENST00000324787 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC110048.2-201ENST00000617013 6721 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC19A3-201ENST00000258403 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF217-201ENST00000302342 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TACC2-212ENST00000453444 9158 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 QTRT2-201ENST00000281273 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 LILRB4-204ENST00000391736 4002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 EFHC1-213ENST00000635996 2548 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEK1-203ENST00000507142 5556 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLAC4-201ENST00000623119 5588 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005520.1-201ENST00000556551 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLTCL1-211ENST00000621271 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLDN2-203ENST00000541806 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR9I1-202ENST00000641439 3184 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP72-201ENST00000362327 292 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP69-201ENST00000364477 117 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDUFA3-202ENST00000391762 435 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms