Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ITIH4-201ENST00000266041 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CYB561A3-202ENST00000426130 3205 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP1-204ENST00000354411 4332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 JAM2-206ENST00000480456 4337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 KLK10-201ENST00000309958 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PAQR5-202ENST00000395407 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRP-203ENST00000518525 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM81A-201ENST00000288228 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 IL17RD-202ENST00000320057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 VCL-201ENST00000211998 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM86EP-201ENST00000313946 2845 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF250-201ENST00000292579 6364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-67P-201ENST00000384446 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR637-201ENST00000385000 99 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 Z83839.1-201ENST00000423412 630 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL354761.1-201ENST00000434190 526 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL395P-201ENST00000462960 291 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL554P-201ENST00000468197 292 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL107P-201ENST00000478127 283 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC091163.2-201ENST00000519032 460 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL020996.2-202ENST00000527604 334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009108.2-201ENST00000566485 269 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC087164.1-201ENST00000577847 513 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC068338.3-201ENST00000617892 418 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 BCAS3-233ENST00000626960 227 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 POLR3G-204ENST00000504930 3251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAF1-203ENST00000546084 3715 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 COL4A6-208ENST00000538570 6528 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 USP6NL-202ENST00000379237 4546 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DLAT-202ENST00000393051 3517 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PTK7-213ENST00000481273 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM172A-201ENST00000395965 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 METTL15-203ENST00000406787 4304 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DDR1-223ENST00000324771 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 HIP1-204ENST00000434438 7066 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02159-202ENST00000518580 2323 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 KALRN-201ENST00000240874 6537 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM215-201ENST00000342743 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DCANP1-201ENST00000503143 3135 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF207-201ENST00000377939 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TFCP2L1-201ENST00000263707 9292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RFX6-201ENST00000332958 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 EPS15L1-212ENST00000597937 3486 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms