Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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CDO1Q16878 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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