Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITSN1Q15811 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ITSN1Q15811 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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