Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH11-212ENST00000620169 13670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSTCD-211ENST00000515279 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITSN2-213ENST00000622089 5805 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 NHS-204ENST00000615422 8860 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNJ1-202ENST00000382491 6958 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF423-203ENST00000561648 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALR1-201ENST00000299727 10044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 C18orf32-203ENST00000613385 5395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARNT2-207ENST00000533983 6690 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACOT13-203ENST00000537591 4391 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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