Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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