Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 SFXN2-201ENST00000369893 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CFAP44-201ENST00000295868 3377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 QTRT2-201ENST00000281273 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SOCS4-204ENST00000555846 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 BCL2L13-216ENST00000616863 4761 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TCTN2-201ENST00000303372 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 B4GALT1-201ENST00000379731 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ATXN1L-201ENST00000427980 7886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 BBS7-201ENST00000264499 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 KLHL18-201ENST00000232766 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LILRB5-201ENST00000316219 3236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFYVE26-201ENST00000347230 9675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 EPB41L4A-211ENST00000621003 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PIGO-203ENST00000378617 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SEMA4D-211ENST00000438547 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC026362.2-201ENST00000624878 5566 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRR-201ENST00000283228 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01597-201ENST00000380888 4472 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SH2D4B-201ENST00000313455 2889 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNMA1-245ENST00000638759 3723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR219A1-201ENST00000362166 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA71C-201ENST00000364642 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SNRPGP11-201ENST00000411777 232 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL671883.1-201ENST00000421191 306 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC108868.1-201ENST00000431411 554 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 IQCF4-204ENST00000433169 414 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC016968.1-201ENST00000479610 697 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL630P-201ENST00000483714 297 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL843P-201ENST00000485262 297 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL573P-201ENST00000485340 276 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL130P-201ENST00000489463 305 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NOS2P4-201ENST00000582696 205 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL731P-201ENST00000584329 293 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SETD5-201ENST00000302463 4786 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC7A3-201ENST00000298085 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AKAP9-216ENST00000619023 6006 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 STAC2-201ENST00000333461 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LAMA1-201ENST00000389658 9657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP2B2-203ENST00000383800 8900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RALGDS-204ENST00000393157 3689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NUP98-205ENST00000397007 3698 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM111A-202ENST00000420244 3780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ETV6-202ENST00000396373 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRG1-266ENST00000568908 3852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RAPGEF3-202ENST00000395358 4092 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms