Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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