Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms