Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms