Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP3Q9Y3E7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP3Q9Y3E7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms