Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms