Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms