Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms