Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms