Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms