Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCC3Q9ULS5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCC3Q9ULS5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms