Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms