Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms