Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms