Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPN3Q9UHW5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms