Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms