Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms