Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms