Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
REREQ9P2R6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
REREQ9P2R6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
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