Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
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