Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms