Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
MBD5Q9P267 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms