Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms