Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMOD2Q9NZR1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMOD2Q9NZR1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMOD2Q9NZR1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms