Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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