Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms