Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms