Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXC10Q9NYD6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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HOXC10Q9NYD6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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HOXC10Q9NYD6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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