Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINM1Q9NU53 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms