Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms