Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A13Q9NSD5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms