Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms