Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms