Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms