Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF3Q9NR81 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms