Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CNGB3Q9NQW8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CNGB3Q9NQW8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CNGB3Q9NQW8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CNGB3Q9NQW8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CNGB3Q9NQW8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CNGB3Q9NQW8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CNGB3Q9NQW8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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CNGB3Q9NQW8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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CNGB3Q9NQW8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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CNGB3Q9NQW8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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CNGB3Q9NQW8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CNGB3Q9NQW8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGB3Q9NQW8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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