Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms