Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLSPNQ9HAW4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms