Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC52A2Q9HAB3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms