Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W1

MS4A6A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6AQ9H2W1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MS4A6AQ9H2W1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MS4A6AQ9H2W1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MS4A6AQ9H2W1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MS4A6AQ9H2W1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MS4A6AQ9H2W1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MS4A6AQ9H2W1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MS4A6AQ9H2W1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MS4A6AQ9H2W1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MS4A6AQ9H2W1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MS4A6AQ9H2W1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MS4A6AQ9H2W1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms